关于曹操安葬的地点，后人也提出了不同的见解。一种说法认为，曹操陵位于铜雀台正南5公里的灵芝村。乾隆五十二年(1787年)写成的《彰德府志》上就明确标着，魏武帝陵在灵芝村，而在其南，紧邻着甄后的朝阳陵。
甄后，即曹丕之妻甄文昭。她原为袁绍二儿子袁熙之妻。曹操打败袁绍进入邺城后，曹丕捷足先登，入袁府，见其美貌绝伦，遂纳之为妻。后甄氏失宠，被曹丕赐死，葬于邺城。
曹操之墓为何与其儿媳墓连在一起呢?这中间还有些故事呢。原来，曹操在攻打袁绍之前，早已听说了甄氏的美貌，但其子曹丕捷足先登，作为父亲，怎能夺儿子之美呢?再说，曹操和袁绍同辈，若娶其儿媳为妻，岂不贻笑于天下!
虽然甄氏被儿子娶走，但做父亲的还是念念不忘。曹操与甄氏的关系还真有些微妙，至于二人是否有私情，不敢妄加断语，但从一些现象分析，似乎能找出点线索来。
《后汉书·孔融传》中写道:孔融系名门出身，为孔子二十世孙，自少誉满清流，为人恃才傲物，最后被曹操所杀。这其中最重要的原因是因为孔融给曹操写了一封信。在信中，他嘲笑曹丕纳甄氏乃是“武王伐纣，以妲己赐周公”。曹操未解其意，询问之。孔融答曰:“以今度之，想当然耳。”这“侮漫之辞”，揭了曹操家丑，因为曹操一向以周文公自诩。曹操听了这话，认为孔融是在讲自己，所以盛怒之下，孔融人头落地。
还有一个根据，即是曹丕的表现。曹丕娶甄氏时，是十分喜爱的，但曹操一死，马上就冷落了她。据《魏书》记载，甄氏对曹丕的新宠说了一些不满的话，曹丕知道了甚为震怒，对其百般虐待，最后又下诏书，赐之以毒酒，令她自杀。甄氏不喝毒酒，曹丕的新宠妃子郭氏就用糠塞于其口，趁其喘息之时，强行灌下毒酒，将其害死。另外，曹操死后，曹丕将其父的妃嫔全部召来，供自己玩乐。一次曹丕生病了，其母卞太后前去看望。她掀起门帘一看，见曹丕床侧坐着的女子都是曹操生前的贴心宫妃。太后惊奇地问:“这些人何时被召到你房中来的?”曹丕回答:“父亲刚死，我就召她们来了。”说话时脸上毫无羞愧之色。卞太后见此情形，气愤地说:“你这样做，死了连狗鼠都不吃你!”
从这两点看，曹操似乎与甄氏有暧昧之情，所以才导致了孔融之死和曹丕的报复。也许，正是因为曹操的这段丑事，清朝的学究们才故意将两个人的坟墓绘制在了一起。当然，这仅仅是一种大胆的假设，并无事实根据。
另一种说法认为，曹操陵在其故里谯县的“曹家孤堆”。
1991年第5期《风景名胜》杂志上刊载了一篇题为《魏武故里话曹操》的文章。文章认为，曹家孤堆即是曹操陵，其理由有三:
其一，《魏书·文帝纪》载:“甲午(220年)，军治于谯，大飨六军及谯父老百姓于邑东。”《亳州志》载:“父帝幸谯，大飨父老，立坛于故宅前，树碑曰大飨之碑。”曹操死于该年正月，二日入葬，如果是葬于邺城的话，那曹丕(魏文帝)为何不去邺而返故里？说明曹丕此行目的是为了纪念其父曹操。
其二，《魏书》还说:“丙申，亲祠谯陵。”谯陵就是曹氏孤堆，位于城东20公里处。曹操31岁时曾返乡在此建筑了精舍，而曹丕也于187年生于此处。所以曹丕祠谯陵，其意有二，一不忘所生之地，二祭先王之陵。
其三，亳州有庞大的曹操宗族墓群，其中包括曹操祖父曹腾墓，其父曹嵩墓等，曹操长女曹宪墓也在此处发现，综上可知，曹操之陵亦当在此。
但是这种说法纰漏甚多。其中一个明显的错误是，把曹丕的几次祭祀作为证明曹操之陵在亳州的证据。其实，历代皇帝的祭祀，并不见得只是祭父，更多的是祭祖，如明太祖朱元璋做了皇帝后，派懂得风水的大官到其出生地泗州选址，为其高祖、曾祖、祖父造陵，所以曹丕之于祠谯，只是一种祭拜祖先的活动，并不能证明曹操墓即在此处。至于曹家祖坟在此，曹操之墓也必在此的说法就更显得苍白无力了。
面对“曹墓不知何处去”的尴尬局面，后人不由得发出了“生前欺天，死后欺人”的感叹，而对曹操为人之奸诈也有了更为深入的认识。其实，这只是问题的一个方面。从另一角度看，曹操一生节俭，力主并亲身实践“薄葬”，这在历史上无疑是具有积极意义的。曹操所处的时代，战乱频仍，社会动荡，其采用隐秘的办法处置后事，也是迫不得已。而且这种办法，不仅保护了自己，也使诸多的盗墓贼无从下手，一次次徒劳无功，从这个意义上讲，曹操又是十分明智的。
从曹操入葬至今，时光已流逝了一千多年，曹操的真正陵寝还没有找到踪迹，也许人们是永远找不着了。